Budama, zeytin ağaçlarında mutlaka yapılması gereken bir işlemdir. Çünkü budama yapılmazsa ağaç rastgele dallanıp budaklanmaya başlar. Ayrıca sıklaşan dallar sebebiyle, kimi dallar güneşe ulaşabilmek için uzayıp giderken kimi de altta kalarak cılızlaşır. Bunun sonucunda da ağaç karmaşık bir yapıya bürünür ve çalılaşmaya başlar. Bu durum meyve oluşumunu olumsuz etkiler.

Zeytin ağacı fidanken şekil verilmelidir. Budama işlemi yapılırken kullanılacak olan tüm araçlar kesime hazırlanmalıdır. Sonrasında hangi budamanın (Şekil budaması, mahsül budaması ve gençleştirme budaması) yapılacağına karar verilmelidir. Kesim işlemi kalın daldan ince dala doğru yapılmalıdır. Ayrıca kesimin, dalların birbirine bağlanmasını sağlayan bileziğin üst kısmından yapılması gerekir. Seyreltme budaması, aşağıdan yukarıya değil; taçın tepe kısmından eteğe doğru yapılmalıdır.

Ağaç budamasında her ağaç aynı şekilde kesilmez. Çünkü her ağaç farklı bir kesime ihtiyaç duyar. Bunda ağacın yaşı (genç ya da yaşlı) ve yorgunluğu da etkilidir. Zeytin ağacı budama şekilleri aşağıdaki gibidir:

•    Şekil Budaması: Bu budama şekli  iki ve üç yaşında olan zeytin ağacı fidanlarına yapılır.
•    Mahsul Budaması: Ağacın verimi açaısından mahsul budaması dikkatli bir şekilde yapılmalıdır. Ana dalda ya da diğer dallardan çıkan küçük filizler ağaç için besleyicidir. Bu yzüden bunlar kesinlikle budanmamalıdır. Mahsul budamasında dikkat edilecek nokta, ağacın o yıl elde ettiği mahsül verimidir. Eğer verim yüksekse, ağır budama yapılmamalıdır. Ancak verim düşükse ve ağaç boş yılını yaşamışsa, ağır budama yapılabilir. 
•    Gençleştirme Budaması: Gelişim dengesi bozulan zeytin ağaçlarına gençleştirme budaması yapılması gerekir. Bu budama, tek bir sezonda değil en az üç yıl gibi bir zamana kadar yayılmalıdır.